Borgnine berkahwin lima kali. Perkahwinan pertamanya, dari 1949 hingga 1958, ialah kepada Rhoda Kemins, yang beliau bertemu ketika berkhidmat di Angkatan Laut.[1] Mereka mempunyai seorang anak perempuan, Nancee (lahir 28 Mei 1952). Beliau kemudiannya berkahwin dengan pelakon Katy Jurado dari 1959 hingga 1963. Perkahwinan Borgnine kepada penyanyi Ethel Merman pada tahun 1964 hanya selama 32 hari. Masa mereka bersama-sama kebanyakannya dihabiskan untuk melemparkan penghinaan yang tidak senonoh di antara satu sama lain, dan kedua-duanya kemudian mengakui bahawa perkahwinan itu adalah kesilapan besar. Perceraian mereka telah dimuktamadkan pada 25 Mei 1965.

Dari 1965 hingga 1972, Borgnine telah berkahwin dengan Donna Rancourt, yang mempunyai anak lelaki, Cristopher (lahir 9 Ogos 1969) dan dua orang anak perempuan, Sharon (lahir 5 Ogos 1965) dan Diana (lahir 29 Disember 1970). Pernikahan kelima dan terakhirnya ialah Tova Traesnaes. Borgnine meninggal dunia akibat kegagalan buah pinggang pada 8 Julai 2012 di Pusat Perubatan Cedars-Sinai di Los Angeles, California.[2] Beliau berusia 95 tahun.[3] Berikutan kematiannya,Nickelodeon memberi penghormatan kepadanya dengan dua jam maraton SpongeBob SquarePants yang memaparkan episod yang memfokuskan kepada wataknya.[4][5]